📜  Ukkonen的后缀树构造–第6部分(1)

📅  最后修改于: 2023-12-03 15:20:48.418000             🧑  作者: Mango

Ukkonen的后缀树构造–第6部分

本文是Ukkonen的后缀树构造系列的第6部分。在这一部分中,我们将继续探讨如何在构建后缀树时处理边界扩展问题,并解决一些Ukkonen算法中的复杂性。

1. 背景介绍

Ukkonen的后缀树构造算法是一种高效地构建后缀树的方法。在之前的部分中,我们介绍了如何构建后缀树的第一阶段,其中我们主要关注每个后缀的显式插入过程。

然而,在第一阶段之后,我们需要处理后续的隐式插入操作,即处理以前已插入的后缀的边界扩展。这是后缀树构造过程中的一个关键问题,因为我们需要确保后缀树是完整的。

2. 处理边界扩展

在Ukkonen的算法中,我们使用一个称为active_point的变量来跟踪当前活动节点。当处理边界扩展时,我们需要根据活动节点的情况采取不同的行动。

2.1. 第一种情况

如果活动节点的active_edge为空,说明我们需要在当前活动节点的子节点中查找以后缀开头的字符。如果找到了一个匹配的子节点,我们将active_edge更新为该子节点,并继续处理下一个边界扩展。

2.2. 第二种情况

如果活动节点的active_edge不为空,但它已经指向一个边界扩展字符,那么我们将active_node更新为该边界扩展字符的目标节点,并将active_edge重置为空。这意味着我们将活动节点移动到后一后缀。

2.3. 第三种情况

如果活动节点的active_edge不为空,并且它不指向一个边界扩展字符,那么我们需要在活动节点的active_edge上进行边界扩展。为了实现这一点,我们需要将当前活动边界扩展的字符添加到树中,并且更新active_nodeactive_length

3. 解决算法复杂性

处理边界扩展的步骤可能会导致算法的复杂性增加。为了解决这个问题,Ukkonen引入了一个称为remainder_node的变量,并使用它来加速算法。

remainder_node表示在执行边界扩展之前,需要在树中插入字符的节点。我们可以将其视为将要添加到树中的下一个后缀的节点。通过保存remainder_node,我们可以避免不必要的遍历和搜索操作,从而提高算法的效率。

4. 代码片段

下面是一个示例代码片段,演示了如何在Ukkonen算法的后缀树构造中处理边界扩展。

class SuffixTree:
    def __init__(self, text):
        self.text = text
        self.root = Node()
        self.active_node = self.root
        self.active_edge = None
        self.active_length = 0
        self.remainder_node = None

    def add_suffix(self, suffix):
        self.text += suffix
        self.remainder_node = None
        self.active_length += 1

        while self.active_length > 0:
            if self.active_edge is None:
                # Case 1: Empty active edge
                # Search for matching child node
                if self.active_node.has_child(suffix[0]):
                    self.active_edge = suffix[0]
                else:
                    # Create new child node and link it to the active node
                    new_node = Node()
                    self.active_node.add_child(suffix[0], new_node)
                    self.remainder_node = new_node

            elif self.active_edge == suffix[self.active_length-1]:
                # Case 2: Active edge is at boundary extension character
                self.active_node = self.remainder_node
                self.active_edge = None
                self.active_length -= 1

            else:
                # Case 3: Active edge needs extension
                new_char = suffix[self.active_length-1]
                next_node = self.active_node.get_child(self.active_edge).split(self.active_length-1)
                next_node.add_child(new_char, Node())
                self.active_node = next_node

                # Update active edge, active node, and active length
                self.active_edge = new_char
                self.active_length -= 1

        if self.remainder_node is None:
            self.remainder_node = self.root

    def build_tree(self):
        # Iterate through the text and add suffixes to the tree
        for i in range(len(self.text)):
            suffix = self.text[i:]
            self.add_suffix(suffix)

此代码片段展示了如何使用类来表示后缀树,并实现了在构建过程中处理边界扩展的逻辑。

总结

本文介绍了Ukkonen的后缀树构造算法的第6部分,主要涉及处理边界扩展的方法和解决算法复杂性的技巧。通过这些内容,程序员可以更好地理解后缀树的构建过程,并根据需要进行相应的优化。