📜  将 x 射线 dicom 转换为 png - Shell-Bash (1)

📅  最后修改于: 2023-12-03 14:53:45.671000             🧑  作者: Mango

将 x 射线 dicom 转换为 png - Shell-Bash

在医学图像处理中,DICOM 是最常用的格式。DICOM 文件的格式和结构相对复杂,但它也是最常用的医学图像格式之一。因此,将 DICOM 文件转换为易于分析和处理的其他格式很常见。

本文将介绍如何用 Shell-Bash 将 x 射线 DICOM 文件转换为 PNG 格式的方法。

DICOM to PNG

DICOM 到 PNG 的转换需要使用三个途径:dcmtk、imagemagick、LIBTIFF,这三种工具都可以通过命令行使用。

安装工具
  1. 安装 Dcmtk:
sudo apt-get update
sudo apt-get install dcmtk
  1. 安装 Imagemagick:
sudo apt-get update
sudo apt-get install imagemagick
  1. 安装 LIBTIFF:
sudo apt-get update
sudo apt-get install libtiff5
转换 DICOM 文件
  1. 打开终端,进入 DICOM 文件所在的目录;

  2. 使用 dcmtk 将 DICOM 文件转换为 TIFF 文件:

    dcmj2pnm -p tiff input_file.dcm output_file.tif
    
  3. 使用 imagemagick 将 TIFF 文件转换为 PNG 文件:

    convert output_file.tif output_file.png
    

    或者:

    mogrify -format png output_file.tif
    
程序代码

本文介绍如何将 DICOM 文件转换为 PNG,以下是 Shell-Bash 脚本代码示例:

#!/bin/bash
# 将 DICOM 文件转换为 PNG 格式
# 安装软件
sudo apt-get update
sudo apt-get install dcmtk
sudo apt-get install imagemagick
sudo apt-get install libtiff5
# 转换文件
for f in *.dcm
do
    # 转换为 TIFF 格式
    dcmj2pnm -p tiff "$f" "${f%.dcm}.tif"
    # 再转换为 PNG 格式
    convert "${f%.dcm}.tif" "${f%.dcm}.png"
done
结论

DICOM 文件很常用,将其转换为易于分析和处理的其他格式也很常见。用 Shell-Bash 脚本转换 DICOM 文件为 PNG 格式非常简单易行,可以用于 DICOM 格式图像的后期处理。

以上就是将 x 射线 DICOM 转换为 PNG 的方法和示例。