📜  Julia 中的聚类(1)

📅  最后修改于: 2023-12-03 15:02:27.749000             🧑  作者: Mango

Julia 中的聚类

Julia 中有多种聚类算法可供使用,包括 k-means、DBSCAN、层次聚类等。这些算法在 Julia 的各种数据科学包中都有实现,例如 Clustering.jl、ScikitLearn.jl、StatsBase.jl 等。

k-means

k-means 是一种基于距离度量的聚类算法,目标是将样本划分为 k 个不同的簇,使得簇内元素间的距离较小,簇间元素间的距离较大。

在 Clustering.jl 中,可以使用 kmeans 函数进行 k-means 聚类。下面是一个例子:

using Clustering

# 生成随机数据
X = rand(100, 2)

# 进行 k-means 聚类
result = kmeans(X', 3)

# 获取聚类中心和每个点的标签
centroids = result.centers'
labels = result.assignments

在这个例子中,我们生成了一个随机的 100 个样本,每个样本有 2 个特征,使用 kmeans 函数进行 3 分簇。返回的 result 包含了每个簇的中心和每个点的标签。

DBSCAN

DBSCAN 是一种基于密度的聚类算法,它将密度较高的样本划分到同一个簇中,同时将较为孤立的样本划分为噪声。DBSCAN 算法需要指定样本间的距离度量和两个重要的参数:半径 eps 和样本密度阈值 min_samples

在 ScikitLearn.jl 中,可以使用 DBSCAN 函数进行 DBSCAN 聚类。下面是一个例子:

using ScikitLearn

# 生成随机数据
X = rand(100, 2)

# 进行 DBSCAN 聚类
result = @sk_import cluster: DBSCAN;
model = result(eps=0.1, min_samples=5).fit(X)
labels = model.labels_

在这个例子中,我们生成了一个随机的 100 个样本,使用 DBSCAN 函数进行聚类。返回的 model 包含了每个点的标签,其中 -1 表示噪声。

层次聚类

层次聚类是一种自下而上的聚类方法,它通过构建样本的距离矩阵,逐步将样本进行合并,直到所有样本都被合并为止。层次聚类可以划分为凝聚型和分裂型,分别以合并最近邻样本和分裂距离最远的样本为准则。

在 StatsBase.jl 中,可以使用 linkage 函数进行层次聚类。下面是一个例子:

using StatsBase

# 生成随机数据
X = rand(100, 2)

# 进行层次聚类
labels = linkage(X, "single")

在这个例子中,我们生成了一个随机的 100 个样本,使用 linkage 函数进行层次聚类。返回的 labels 包含了每个点的标签,以及每个合并过程的距离。