如何安装 Pymol - Shell/Bash

Pymol是一款用于分子可视化的开源软件。本文将介绍如何使用Shell/Bash在Ubuntu操作系统中安装Pymol。

系统要求

• Ubuntu操作系统 (本文基于Ubuntu 20.04 LTS进行介绍)
• 稳定的网络连接

步骤

1. 更新软件包

在安装Pymol之前，我们需要先更新系统中的软件包。打开终端并执行以下命令：

sudo apt update && sudo apt upgrade -y

这将更新软件包列表并安装所有可用的更新。

2. 安装依赖项

Pymol需要一些依赖项才能正确地安装和运行。在终端中执行以下命令安装这些依赖项：

sudo apt install python3-dev python3-pip libglew-dev libpng-dev libfreetype6-dev libmsgpack-dev python3-pyqt5

3. 安装Pymol

有几种方法可以安装Pymol。我们将在此处介绍两种方法。

方法1：使用PyPI安装

执行以下命令以使用PyPI安装Pymol：

sudo python3 -m pip install pymol

完成后，您可以通过运行以下命令来启动Pymol：

pymol

方法2：使用Aptitude安装

您也可以使用Aptitude软件包管理器安装Pymol。您需要使用以下命令添加PPA，并更新软件包列表：

sudo add-apt-repository ppa:deadsnakes/ppa && sudo apt update

然后，使用以下命令安装Pymol：

sudo apt install pymol

完成后，您可以通过运行以下命令来启动Pymol：

pymol

结论

现在您已经成功地在Ubuntu操作系统中安装了Pymol。您可以开始使用它来可视化和分析分子数据。如果您遇到任何问题，请查阅Pymol文档或在社区中寻求帮助。