R中的缩放变量平行坐标图

平行坐标图是一种可视化数据的方法，它使用平行的线段来表示多维数据的关系。在此基础上，缩放变量平行坐标图则是在平行坐标图的基础上，通过缩放每个变量使得每个变量在可视化中的权重都相等。

缩放变量平行坐标图在R语言中可以通过ggplot2和GGally包来实现。

ggplot2中的缩放变量平行坐标图

使用ggplot2绘制缩放变量平行坐标图的步骤如下：

1. 原始数据集需要进行归一化处理，将每个变量的取值范围都缩放到[0,1]之间，以保证每个变量在可视化中的权重相等。
2. 使用ggplot2的geom_path函数绘制平行坐标图，通过aes函数来定义每个变量所对应的颜色和大小，从而使得不同变量在图中能够区分开来。
3. 通过coord_flip函数将xy坐标轴进行翻转，使得平行坐标线段按照从左到右的顺序进行排列。

以下是实现代码：

library(ggplot2)

# 数据预处理，将数据归一化到[0,1]
df_norm <- as.data.frame(scale(df))

# 绘制平行坐标图
ggplot(df_norm, aes(x = 1:nrow(df_norm))) +
  geom_path(aes(colour = var1, size = var2)) +
  coord_flip() +
  xlab("") + ylab("") +
  scale_colour_gradientn(colours = rainbow(5))

GGally中的缩放变量平行坐标图

使用GGally绘制缩放变量平行坐标图更为简便，只需要调用ggparcoord函数即可。以下是实现代码：

library(GGally)

# 数据预处理，将数据归一化到[0,1]
df_norm <- as.data.frame(scale(df))

# 绘制平行坐标图
ggparcoord(df_norm, columns = 1:ncol(df_norm), groupColumn = "group",
           scale = "uniminmax", alphaLines = 0.5, alphaPoints = 0.2)

参考资料：

1. ggplot2官方文档，https://ggplot2.tidyverse.org
2. GGally官方文档，https://ggobi.github.io/ggally/