在 R 中自动安装包的所有依赖项 - Shell-Bash

当我们在 R 中安装一个包时，该包的依赖项并不会自动安装，必须手动安装每个依赖项。这个过程有时会很乏味，但是我们可以通过编写一个 Shell 脚本来自动化这个过程。

步骤

1. 在 R 中，使用 install.packages() 命令安装需要的包。例如，我们要安装 ggplot2 包：

   install.packages("ggplot2")
   

2. 创建一个名为 install_r_package.sh 的 Shell 脚本文件。

3. 在 Shell 脚本文件中添加以下命令：

   #!/bin/bash
   
   # 利用 Rscript 脚本调用 R 的 install.packages() 函数
   Rscript -e 'install.packages(commandArgs(TRUE), repos = "http://cran.rstudio.com/")' "$@"
   

   这个脚本会通过 Rscript 命令调用 R，并将 install.packages() 函数用于安装包的依赖项。 "$@" 可以将 Shell 脚本中的任何参数传递给 R。

4. 将 Shell 脚本文件添加到系统路径中。这可以通过运行以下命令完成：

   sudo mv install_r_package.sh /usr/local/bin/
   sudo chmod +x /usr/local/bin/install_r_package.sh
   

5. 在命令行中，运行 install_r_package.sh 脚本，并将需要安装依赖项的包名称作为参数。例如：

   sudo install_r_package.sh ggplot2
   

运行此脚本将安装 ggplot2 包的所有依赖项。

结论

编写一个 Shell 脚本可以自动安装 R 包的所有依赖项。这样的脚本可以节省时间和努力。