📜  使用逻辑函数的 COVID-19 峰值预测(1)

📅  最后修改于: 2023-12-03 15:22:27.142000             🧑  作者: Mango

使用逻辑函数的 COVID-19 峰值预测

简介

随着全球新冠疫情的爆发,预测疫情峰值成为至关重要的问题。本文将介绍如何使用逻辑函数对 COVID-19 疫情峰值进行预测。

逻辑函数简介

逻辑函数是一种特殊的数学函数,也被称为 sigmoid 函数。其函数形式如下:

$$ f(x) = \frac{1}{1 + e^{-x}} $$

在机器学习领域中,逻辑函数常被用作分类算法的激活函数。当输入 x 较大时,函数值趋近于 1;当输入 x 较小时,函数值趋近于 0。

COVID-19 峰值预测

由于新冠病毒的潜伏期等因素的影响,疫情的传播往往出现两个阶段:爆发期和平稳期。因此,我们可以使用两个不同的逻辑函数来对这两个阶段进行建模。

爆发期的传播速度很快,一般采用指数模型来描述。在逻辑函数的框架下,它可以写为:

$$ B(t) = \frac{1}{1 + e^{-(t - t_0) / \alpha}} $$

其中,$B(t)$ 表示在时间点 $t$ 时的新增感染数占总感染人数的比例;$t_0$ 是传播开始的时间;$\alpha$ 是控制传播速度的参数。

平稳期的传播速度较慢,我们可以使用对数模型对其进行描述。在逻辑函数的框架下,它可以写为:

$$ P(t) = \frac{1}{1 + e^{k(t - t_1)}} $$

其中,$P(t)$ 表示在时间点 $t$ 时的患病人数占总人口的比例;$t_1$ 是平稳期开始的时间;$k$ 是传播速度控制参数。

最终,我们可以将爆发期和平稳期的模型结合起来,得到整个疫情期间的模型:

$$ C(t) = B(t) + (1 - B(t))P(t) $$

其中,$C(t)$ 表示在时间点 $t$ 时的患病人数占总人口的比例。

实现步骤

对于 COVID-19 峰值预测的实现,我们可以按照以下步骤进行:

  1. 收集和清洗数据。我们需要收集时间序列数据(例如每天的新增感染数和总感染人数)并进行清洗和预处理,以便进行后续的建模。

  2. 初步拟合爆发期模型。我们可以使用拟合算法(例如最小二乘法)来确定 $t_0$ 和 $\alpha$ 的值。

  3. 对平稳期数据进行处理。由于平稳期的传染速度较慢,患病人数的增长速度也会变缓,我们可以使用对数变换来处理数据,然后拟合对数模型,以预测 $t_1$ 和 $k$ 的值。

  4. 使用拟合出来的参数,根据时间序列数据,计算出在每个时间点的 $B(t)$ 和 $P(t)$,最后将它们代入整个模型 $C(t)$ 中,得出每个时间点的疫情预测值。

代码实现

参考代码如下所示:

import numpy as np
from scipy.optimize import curve_fit

def logistic(t, a, b, c):
    return c / (1 + a * np.exp(-b*t))

def log_curve(t, a, b, c, d):
    return c / (1 + a * np.exp(-b*t)) + d

def fit_log_curve(x_vals, y_vals):
    p0 = [0, 0, 0, 0]
    popt, pcov = curve_fit(log_curve, x_vals, y_vals, p0=p0)
    return popt

def calc_outbreak(t_vals, t0, alpha):
    return [logistic(t, alpha, (t - t0) / alpha, 1) for t in t_vals]

def calc_plateau(t_vals, t1, k):
    return [logistic(t, k, -(t - t1)*k, 1) for t in t_vals]

def calc_log_curve(x, t0, alpha, t1, k):
    outbreak_data = calc_outbreak(x, t0, alpha)
    plateau_data = calc_plateau(x, t1, k)
    return [outbreak_data[i] + (1 - outbreak_data[i]) * plateau_data[i] for i in range(len(x))]

其中,logistic 函数用来计算逻辑函数的值,log_curve 函数用来拟合两个逻辑函数的和,fit_log_curve 函数用来对时间序列数据进行拟合,得到参数 $t_0$, $\alpha$, $t_1$, $k$ 的值,calc_outbreakcalc_plateau 函数分别用来计算爆发期和平稳期的预测值,calc_log_curve 函数最终用来计算整个模型的预测值。

总结

使用逻辑函数的 COVID-19 峰值预测方法可以帮助我们对疫情趋势进行初步预估。然而,这种方法并不考虑各种外部因素(例如政府采取的干预措施、人们的行为规范等),因此结果仅供参考,并不绝对准确。在实际应用中,建议结合其他预测方法来进行综合预测。